Moing,
zu Vibrationen könnte es kommen, wenn die neue Kupplung nicht richtig zentriert oder z.b. ein Motorlager verspannt eingebaut wurde. Kupplung falsch montiert kannst im prinzip so testen:
Im Leerlauf den Fuß ganz leicht aufs Kupplungspedal legen und wenn es pulsiert, ist das was schiefgelaufen
An der Kupplung selbst wirds wohl nicht liegen, ich hab bei meinem nichts von vibrationen festgestellt.
Geradeauslauf kann auch sein, wird ja der komplette Achsträger, der Motor und Getriebe trägt, ausgebaut. Im normalfall wird daher nach der Reparatur eine Achsvermessung durchgeführt und entsprechend eingestellt. Da würde ich mal das Protokoll der Achsvermessung anfordern